Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms