Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR7Q8N806 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms