Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms