Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF2Q8N3S3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms