Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD3Q8N144 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms