Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms