Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NME9Q86XW9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NME9Q86XW9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms