Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM50Q86XT4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms