Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD3Q86TU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD3Q86TU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD3Q86TU7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD3Q86TU7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETD3Q86TU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms