Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms