Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms