Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms