Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAD11Q709F0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms