Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBC1D9Q6ZT07 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBC1D9Q6ZT07 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBC1D9Q6ZT07 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms