Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms