Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC129Q6ZRS4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms