Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPNTQ6UXI9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPNTQ6UXI9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPNTQ6UXI9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms