Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms