Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE2Q6PIF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms