Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTR9Q6PD62 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms