Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6P435 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6P435 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6P435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6P435 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6P435 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6P435 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6P435 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6P435 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms