Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R18Q6NYC8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R18Q6NYC8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms