Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD4Q6IC98 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms