Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms