Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM104BQ5XKR9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms