Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL1Q5VZK9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms