Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms