Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF18Q5VWM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms