Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.9 ms