Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms