Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RPRD2Q5VT52 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPRD2Q5VT52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms