Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms