Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATAT1Q5SQI0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms