Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB41Q5JT25 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms