Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms