Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms