Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM41BQ5BJD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM41BQ5BJD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms