Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC44A4Q53GD3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms