Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN3Q4LDR2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTXN3Q4LDR2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms