Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms