Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO43Q4G163 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO43Q4G163 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms