Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTC1Q2NKJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms