Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RTL8BQ17RB0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RTL8BQ17RB0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RTL8BQ17RB0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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