Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN1Q16658 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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