Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GABRA6Q16445 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABRA6Q16445 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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