Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PRR4Q16378 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms