Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms