Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP6AP1Q15904 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6AP1Q15904 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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