Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA2Q15822 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms