Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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